海南东寨港国家级自然保护区位于海南省东北部，处于海口市和文昌市的交界处，地理坐标为东经110°32′～110°37′，北纬19°51′～20°1′，属湿地类型的自然保护区。保护区总面积3337.6 公顷，核心区面积1635公顷，缓冲区面积1167.1公顷，实验区面积535.5 公顷，其中红树林面积1578.2公顷，滩涂面积1759.4公顷。 东寨港是在300多年前，即1605年的一次大地震中，地层下陷形成的，海岸线曲折多弯，海湾开阔，形状似漏斗，滩面缓平，微呈阶梯状，有许多曲折迂回的潮水沟分布其间。涨潮时沟内充满水流，滩面被淹没；退潮时，滩面裸露，形成分割破碎的沼泽滩面。红树林就分布在海岸浅滩上。海岸地区是微咸沼泽地，海湾水深一般在4米内，海水含氯量最高为33.44%，最低为9.3‰，平均为21.86‰． 保护区属于热带季风气候，年平均气温为23.8 ℃（7月份平均28.4℃，1月份平均17.1℃ ），年降雨量1700毫米，雨季多台风，带来狂风暴雨。海水温度最高32.6℃，最低14.6℃，平均24.5℃ 保护区东有马陵沟、演洲河，南有三江河，西有演丰东、西河，北有塔市桃兰溪，此外还有若干短小河道流经保护区入海。